分子结构可视化是现代科学研究的重要组成部分。通过图形化工具或计算机技术,将分子的三维结构以图像或动画的形式呈现出来,能够帮助科学家、教师和学生更直观地理解和分析分子的几何形状以及物理化学性质。传统的分子结构可视化软件如Diamond、Chimera、PyMOL等虽已在学术界广泛使用,但在渲染质量、动画表现力和可交互性等方面则受到较大的限制。Blender作为一款高效灵活的三维建模与渲染工具,拥有自由度高、可扩展性强、跨平台和开源等特性,近年来在科学可视化方面的应用越来越广泛。
ChemBlender是一款基于Blender的分子结构可视化插件,支持各种有机小分子、晶体结构、生物大分子的三维建模。插件采取Blender Python和几何节点联用的方式,让用户可以对生成的模型进行自定义编辑,如原子的大小和材质,分子的显示模式等。为了使得分子结构的编辑更加智能化,ChemBlender在生成模型时保留了分子原有的化学和生物等信息,方便用户在更多的自定义操作中自由访问。
这里暂时仅公开2023年开发的ChemBlender_alpha版本(原名“Mol3DStruct”)。点此下载插件安装包和第三方Python库辅助文件。由于ChemBlender_alpha版本是基于Blender 4.0开发的,推荐在4.0版Blender中使用,这里是使用手册。新版本的ChemBlender插件仍在开发中,敬请期待!
附:任意版本Blender下载地址(https://download.blender.org/release/)